El programa de Magíster en Estadística tiene como propósito  formar al más alto nivel en el desarrollo y aplicación de metodología estadística, tanto para la comprensión de fenómenos, obtención de conocimiento, como para el proceso de toma de decisiones y eficiencia en el uso de los recursos.

El Programa de Magíster en Astrofísica de la Universidad de Valparaíso se caracteriza por contribuir a la formación de nuevos científicos capaces de producir y transferir conocimientos en el área de la astrofísica, capacitando al estudiante con conocimientos formales y experiencia de investigación en astrofísica.

Este Programa tiene como objetivo entregar una formación sólida y de excelencia en las áreas fundamentales de la matemática y capacitar en la investigación inicial, de modo que el graduado pueda incorporase a grupos de investigación o proseguir estudios especializados.

El Programa entrega conocimientos fundamentales acerca del origen, desarrollo, funcionamiento normal y patológico del sistema nervioso en sus diferentes niveles de organización biológica, desde la molécula al comportamiento.

Este programa tiene como objetivo primordial el formar recurso humano calificado que pueda realizar investigación básica y aplicada en el ámbito de la biodiversidad y la conservación de recursos naturales renovables, tanto en ecosistemas terrestres como acuáticos

El Doctorado en Estadística, dependiente del Instituto de Estadística de la Facultad de Ciencias, una de las primeras unidades académicas del país formadora de esta área y pionera en la región, es un programa que busca formar graduados al más alto nivel en metodología y teoría estadística.

Este doctorado tiene como objetivo formar recursos humanos para realizar investigación científica en Astrofísica. Chile cuenta con infraestructura de telescopios e instrumentación astronómica de excelencia mundial, garantizando el 10% del tiempo de observación a quienes trabajan en Instituciones chilenas.

Es un programa conjunto entre tres instituciones que constituyen un importante polo de desarrollo científico-tecnológico en el país, siendo las de mayor tradición en el área matemática de la V Región: Pontificia Universidad Católica de Valparaíso, Universidad Técnica Federico Santa María y Universidad de Valparaíso

El programa tiene el propósito de potenciar y fortalecer la investigación científica, contribuyendo al desarrollo regional y nacional a través de la formación de investigadores con altos niveles de excelencia e idoneidad para incorporarse a universidades, centros de investigación o empresas innovadoras del país o el extranjero.

El Programa de Ciencias Biológicas mención en Neurociencias entrega los conocimientos fundamentales acerca del origen, del desarrollo y del funcionamiento normal y patológico del sistema nervioso en todos sus diferentes niveles de organización biológica, abarcando desde la molécula hasta el comportamiento de ésta.

Este Programa de Doctorado se propone como principal objetivo formar científicos capaces de comprender los procesos biológicos desde un enfoque físico-matemático, promoviendo la integración de estudios interdisciplinarios, cubriendo desde el nivel molecular hasta el modelamiento matemático de sistemas biológicos.

Formar investigadores con la capacidad de generar e integrar conocimientos de las áreas de las Ciencias, Ingeniería y Medicina que permitan dar respuesta y soluciones, con un enfoque interdisciplinario, a problemáticas en el ámbito de la salud.

Es un programa consorciado entre tres universidades estatales regionales que conlleva diversidad científica en la disciplina y pluralidad cultural. Este programa es esencialmente de carácter teórico y propende a contribuir al conocimiento de frontera en la disciplina.